Web Syllabus(講義概要)
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生物システム学演習Ⅰ
英文名Exercises in Biological Systems AnalysisⅠ
科目概要物理学科 3年 3群科目 A選択 2単位 前期 15 コマ 演習
科目責任者小寺 義男
担当者松井 崇※
備考科目ナンバリング:SP302-PB34

授業の目的

生物・生命を理解するためには、遺伝子、蛋白質を網羅的にとらえようとするゲノム・プロテオーム的な視点と、生体分子間の相互作用を分子オーダーで理解するための構造生物学的な視点、さらには、これらをもとに生物をシステムとして捉えるための生物システム学的な視点が必要である。本演習では、生物システム学的な視点から生物、病気を理解するために必要なゲノミクス、プロテオミクスについて理解することを目標とする。
また、プロテオミクス研究ならびに立体構造解析研究について、外部講師による研究紹介を通して、進展著しい生物システム学の最前線を知り、この学問分野の現在地に関する理解を行う。

DPとの関連

SP2

教育内容

ゲノム解析について概説し、そこから得られた膨大な生物情報のデータベースについて説明し、データベースの調べ方、使い方について講義する。また、分子生物学的なアプローチによる生物医学研究の例を紹介する。

教育方法

プリントを配布し、それに沿ってパワーポイントを使って進める。

授業内容

項目内容担当者日時
第1回~2回生物システム学 序論(1)生物システムにおける蛋白質分子、多様性と表現型、生物システムを理解するための2 つの視点小寺 義男
6/10③④
第3回~4回質量分析計の基礎質量分析計の基礎小寺 義男
6/17③④
第5回~6回プロテオミクス(1)質量分析計と質量分析データの解析、蛋白質・ペプチドの質量分析小寺 義男
6/24③④
第7回~8回プロテオミクス(2)蛋白質同定法、データベース検索小寺 義男
7/1③④
第9回~10回プロテオミクス(3)データサイエンスとプロテオミクスの最前線小寺 義男
7/8③④
第11回~12回蛋白質物性の理解(1) 蛋白質の立体構造と機能について概説する松井 崇
7/15③④
第13回~15回蛋白質物性の理解(2)細胞内における蛋白質の物性(機能と相互作用)について考える松井 崇
7/22③④⑤
第1回~2回
項目
生物システム学 序論(1)
内容
生物システムにおける蛋白質分子、多様性と表現型、生物システムを理解するための2 つの視点
担当者
小寺 義男
日時
6/10③④
第3回~4回
項目
質量分析計の基礎
内容
質量分析計の基礎
担当者
小寺 義男
日時
6/17③④
第5回~6回
項目
プロテオミクス(1)
内容
質量分析計と質量分析データの解析、蛋白質・ペプチドの質量分析
担当者
小寺 義男
日時
6/24③④
第7回~8回
項目
プロテオミクス(2)
内容
蛋白質同定法、データベース検索
担当者
小寺 義男
日時
7/1③④
第9回~10回
項目
プロテオミクス(3)
内容
データサイエンスとプロテオミクスの最前線
担当者
小寺 義男
日時
7/8③④
第11回~12回
項目
蛋白質物性の理解(1)
内容
蛋白質の立体構造と機能について概説する
担当者
松井 崇
日時
7/15③④
第13回~15回
項目
蛋白質物性の理解(2)
内容
細胞内における蛋白質の物性(機能と相互作用)について考える
担当者
松井 崇
日時
7/22③④⑤

到達目標

生物システム学について理解し、ゲノム解析を基盤にした医学・生命科学に対する生物システム学的なアプローチについて知る。

評価基準

授業中の演習への積極的な取り組み(70%)とレポート(30%)により総合的に評価する。

準備学習(予習・復習)

【授業時間外に必要な学習時間:1コマあたり 4 時間】
予習:1 回目、2 回目は生物物理学Ⅰの前半部分に目を通しておく。
   2 回目以降は、前回の講義でしめされた内容について調べておく。
復習:講義内容をもとにレポート課題を行い、講義内容とその関連事項の深い理解に努める。

実務経験のある教員情報

松井 崇:企業での研究・開発経験をもとに、物理的な考え方の重要性について解説する。

関連科目

生物物理学序論、生物物理学I、生物物理学II、生物物理化学

その他

・講義中に課題を出した場合、重要な部分ならびにその応用部分について解説し、議論する。
・講義終了後にレポート課題を出し、以後の授業でその内容について議論する。

教材

種別書名著者・編者発行所
教科書プリント配布
参考書Essential タンパク質科学Mike Williamson 著
津本浩平、植田 正、前仲勝実 監訳
南江堂
教科書
署名
プリント配布
著者・編者
発行所
参考書
署名
Essential タンパク質科学
著者・編者
Mike Williamson 著
津本浩平、植田 正、前仲勝実 監訳
発行所
南江堂